Laitoksen toiminnasta vastaa laitoksen johtaja ja yksi varajohtaja. Vuonna 2011 laitoksen johtajana toimi professori Esko Ukkonen ja varajohtajana professori Jyrki Kivinen. Laitoksella on lisäksi laitosneuvosto, jonka muodostavat kolme professoria, kolme muun henkilökunnan edustajaa ja kolme opiskelijaa. Laitosneuvoston jäsenet valitaan vaaleilla joka neljäs vuosi. Laitosneuvostolla on sihteeri, joka huolehtii kokousasiakirjojen jakelusta.

Opetus jakaantuu kolmeen erikoistumislinjaan sekä kahteen maisteriohjelmaan. Erikoistumislinjojen esimiehet vuonna 2011 olivat professori Jyrki Kivinen (algoritmit ja koneoppiminen), professori Sasu Tarkoma (hajautetut järjestelmät ja tietoliikenne) ja professori Jukka Paakki (ohjelmistojärjestelmät). Maisteriohjelmien esimiehet olivat professori Veli Mäkinen(Master's Degree Programme in Bioinformatics, MBI) ja professori Jussi Kangasharju (International CBU Master's Degree Programme in Information and Communication Technology). Laitos osallistuu neljään tutkijakouluun; Hecse-tutkijakoulun johtajana toimi lisäksi professori Hannu Toivonen(1.1.-31.5.2011) ja Petri Myllymäki(1.6.-31.12.2011).

Tutkimus on organisoitu tutkimusyksiköihin ja -ryhmiin. Laitoksella toimii kaksi tutkimusyksikköä, Tietotekniikan tutkimuslaitos HIIT (yhteislaitos Aalto-yliopiston kanssa) ja Suomen Akatemian Algoritmisen data-analyysin huippuyksikkö (Algodan). Tutkimusyksiköiden lisäksi laitoksella on tutkimusryhmiä, jotka toimivat myös yksiköiden sisällä. HIITin johtajana toimi vuonna 2011Aalto-yliopiston professoriSamuel Kaskija Algodanin johtajana professori Esko Ukkonen<

Hallinto jakaantuu (1) opintohallintoon, josta vuonna 2011 vastasi opintoesimies Jaakko Kurhila, (2) yleis-, henkilöstö- ja taloushallintoon, josta vastasi toimistopäällikkö Pirjo Mulari, (3) tutkimus- ja tutkijankoulutushallintoon, josta vastasi tutkimuskoordinaattori Greger Lindén(1.1.-31.5.2011) ja tutkimuskoordinaattori Pirjo Moen (1.6.-31.12.2011), sekä (4) tietotekniikkaan, josta vastasi tietotekniikkapäällikkö Petri Kutvonen. Lisäksi laitoksella on opintotoimikunta, jatko-opintotoimikunta, opetuksen kehittämistyöryhmä, työhyvinvointiryhmä sekä kirjastoyhteyshenkilö. Laitoksen henkilökunta on edustettuina myös tiedekunnan ja yliopiston toimikunnissa.

Vuoden 2011 laitosneuvosto

Laitosneuvoston kokoonpano kaudella 2010-13 on seuraava:

Toimikuntajäsenyydet

Opintohallintotoimikunta

Toimikuntaan kuuluvat tehtävänsä perusteella opintoesimies, laitoksen varajohtaja ja erikoistumislinjojen johtajat.

Jyrki Kivinen (pj)
Sasu Tarkoma
Jukka Paakki
Veli Mäkinen (MBI)
Jaakko Kurhila

Jatko-opinto- ja tutkimusasioiden toimikunta

Jussi Kangasharju (pj)
Jyrki Kivinen
Jukka Paakki
Greger Linden (siht., 1.1.-31.5.2011)
Pirjo Moen (siht., 1.6.-31.12.2011)

Opetuksen kehittämistyöryhmä

Heikki Lokki (pj)
Sasu Tarkoma
Jaakko Kurhila
Pirjo Moen
Sini Ruohomaa
Ella Peltonen
Tatu Tahvanainen
Olli Rissanen
Taina Kaivola (puheoikeus)
Nina Aremo (puheoikeus)

Työhyvinvointiryhmä

Suomenkielinen ryhmä

Tiina Niklander (pj)
Jani Jaakkola
Janne Korhonen
Teija Kujala
Matti Luukkainen
Pauliina Pajunen
Juho Rousu
Pekka Tonteri

International group

Yi (Aaron) Ding , pj
Doris Entner
Eve Hoggan
Alex Norta
Valentin Polishchuk
Sini Ruohomaa
Yiyun Shen
Roman Yangarber
Ellen Mustonen, yhteyshenkilö

Laitoksen edustajia yliopiston, tiedekunnan ja muissa toimikunnissa

Yliopistokollegio: Esko Ukkonen

Yliopiston yhteiskunnallisen vuorovaikutuksen neuvosto (YNE): Esko Ukkonen

Yliopiston hallinnon ja tukipalveluiden ohjausryhmä (HATU): Esko Ukkonen

Yliopiston tohtorikoulutustoimikunta: Hannu Toivonen

Yliopiston kongressipalveluiden kartoitustyöryhmä: Pirjo Moen

Yhteisvalinnan kysymystyöryhmä (valtakunnallinen): Patrik Floréen

Tiedekuntaneuvoston jäsenet:

• Hannu Toivonen (varajäsen Esko Ukkonen)
• Petri Kutvonen (varajäsen Teija Kujala)

Tiedekunnan tieteellinen asiantuntijaryhmä (MATIAS): Hannu Toivonen

Tiedekunnan alumni- ja varainhankintatyöryhmä (AVARA): Petri Myllymäki

Tiedekunnan jatkotutkintotoimikunta: Hannu Toivonen

Tiedekunnan opintoasiaintoimikunta: Jaakko Kurhila (varajäsen Heikki Lokki)

Tiedekunnan valintalautakunta: Jyrki Kivinen (varajäsen Otto Nurmi)

Tiedekunnan opetustaitotoimikuntapooli:

• Professorit: Seppo Sippu, Sasu Tarkoma, Hannu Toivonen
• Muut opettajat ja tutkijat: Jaakko Kurhila, Harri Laine
• Opiskelijat: Tatu Tahvanainen

Tiedekunnan kansainvälistymissuunnitelmatyöryhmä: Pirjo Moen

Kumpulan tiedekampuksen viestintäryhmä: Sasu Tarkoma

Kumpulan kampuskirjastoneuvottelukunta: Jyrki Kivinen (varajäsen Sasu Tarkoma)

Kumpulan kampuksen infrastruktuurityöryhmä: Esko Ukkonen

Bioinformaatioteknologiaselvityksen ohjausryhmä: Veli Mäkinen

Laitoksen kirjastoyhteyshenkilö: Teija Kujala

LUMA-keskuksen johtoryhmä: Esko Ukkonen

LUMA Resurssikeskus Linkki: johtaja Jaakko Kurhila

Tietotekniikan tutkimuslaitoksen HIITIn johtokunta: Hannu Toivonen (varajäsen Jukka Paakki)